過去在兩岸對峙時代,華航的航權談判受到中國大陸打壓,處處碰壁,華航因而在 1991 年成立子公司華信航空( Mandarin Air ),專飛有政治敏感的航線。
在歐洲許多國家機場,旅客到櫃檯報到搭乘回台的航空公司是華信航空的代碼 AE ,而不是華航的代碼 CI 。目前兩岸運量占華信總運量超過 3 成,也因此如果兩岸關係持續惡化,其中一方政府宣布終止兩岸定期航班,華信將會損失慘重。
華航的英文名稱是「China Airlines」, 雖然許多獨派人士不滿意名稱,但是經營一甲子以來,已在國際民航市場上占有一片天,也是「天合聯盟」(SkyTeam)的成員之一,民眾搭機也不會與中國大陸的「中國國際航空」( Air China )搞混。改名後,等於是讓中國大陸的航空公司撿到便宜,可以延用「China Airlines」的名稱。